1. "против экстрасенсов из застенков [критично?] секретных организаций[, короче говоря, заниматься такими делами] [это из текста, или твой комментарий?]"
- "застенки" - не то слово, оно в данном случае неупотребимо.
- "короче говоря, заниматься такими делами" - так в тексте, без скобок.
2. "Надо подумать. В оригинале почти дословно: "сам я никакими особыми особенностями не обладаю, как мне с ними соперничать плана нет. И над этим я думал.".
- …как бы я вообще с ними сражался? У меня ведь нет никаких суперспособностей! И над этим я думал.
3. По поводу религии я еще уточню.
4. "По определенным причинам… эээ… вот чего-то опять немного захотелось" - да, так.
"Пока изучал наибольшие возможные общие делители, уже вырос". Во всяком случае, лексика такая, смысл в том, что "пока учился - смотрю, уже вырос".
- можно так, чтоб более по-русски: "Пока корпел над дробями и уравнениями, смотрю - уже вырос".
Если какие-то добавления будут, я сам поправлю в тексте.